教程(七):分子轨道(1)

发表时间:2021-04-13 18:06作者:李宏平/绎模科技

分子轨道(一)



(一)引言

  • 在量子化学计算中,通常需要绘制出分子轨道用于分析分子的物理化学性质。本系列将由简入深,逐渐介绍分子轨道的绘制、分子轨道的成分分析以及在实际研究中的作用。

  • 本文以苯分子为例,首先介绍分子轨道的绘制。


(二)计算过程

1. 准备fchkwindowsGaussianchk文件即可)文件。

  • 软件版本Linux Gaussian16, Windows GaussView6,使用方法B3LYP/6-31G(d);chk文件名为benzene.chk。

  • 输入文件benzene.gjf如下:

7-1.jpg


  • 优化得到稳定结构后,在当前目录下会生成benzene.chk文件,然后使用formchk功能处理得到benzene.fchk文件,如下所示:

7-2.jpg



2. Windows GaussView6 绘制分子轨道

  • 得到benzene.fchk文件后,从服务器下载到本地,然后打开,得到下图:




7-3.jpg


  • 点击GaussView6面板上的分子轨道图标 ,得到新的分子轨道面板:

a.下图中,右边为分子轨道列表,数值为分子轨道能量(原子单位),黄色部分为需要绘制的分子轨道(此例中分别为HOMOLUMO

b.从图中可以看出HOMO, HOMO-1能量相同,因此是简并轨道。同理,苯分子还有很多简并轨道。

       c.点击下方Visualize 中的update按钮即可产生分子轨道。

7-4.jpg


e.得到的HOMO及LUMO轨道如下所示:


7-5.jpg


苯分子的HOMOLUMO轨道图形



f.从上图可以看出,HOMO轨道是由C原子p轨道组成的成键π轨道,而LUMO则是C原子p轨道组成的反键π轨道

g.使用GaussView6 可以把苯分子所有的分子轨道都绘制出来,例如教科书中常用的大π轨道:


7-5.jpg


苯分子的大π轨道(HOMO-4)





(三)知识背景

  • 分子轨道理论参考: 《结构化学基础》,周公度,第5版。

  • 分子轨道理论又称分子轨道法(Molecular Orbital Theory)MO法,1932年由美国化学家马利肯(R.S.Mulliken)及德国物理学家洪特(F.Hund)提出,是现代共价键理论之一。它的要点是:从分子的整体性来讨论分子的结构,认为原子形成分子后,电子不再属于个别的原子轨道,而是属于整个分子的分子轨道,分子轨道是多中心的;分子轨道由原子轨道组合而成,形成分子轨道时遵从能量近似原则、对称性一致(匹配)原则、最大重叠原则,即通常说的成键三原则;在分子中,电子填充分子轨道的原则也服从能量最低原理、泡利不相容原理和洪特规则。

  • 分子轨道理论可以用于解释配合物的稳定性、芳香性物质的稳定性以及有机化学中的狄尔斯-阿德耳反应(Diels-Alder Reaction)等。


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